MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Buchnera aphidicola str. Tuc7 (Acyrthosiphon pisum) chromosome

Total Repeats: 17128

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011834	TTTAA	2	10	200	209	40 %	60 %	0 %	0 %	219681946
2	NC_011834	GTT	2	6	227	232	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219681946
3	NC_011834	AGC	2	6	256	261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219681946
4	NC_011834	TCA	2	6	269	274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219681946
5	NC_011834	ATT	2	6	292	297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219681946
6	NC_011834	CTCA	2	8	299	306	25 %	25 %	0 %	50 %	219681946
7	NC_011834	A	6	6	306	311	100 %	0 %	0 %	0 %	219681946
8	NC_011834	GGT	2	6	395	400	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219681946
9	NC_011834	ATG	2	6	401	406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219681946
10	NC_011834	CTG	2	6	465	470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219681946
11	NC_011834	CTA	2	6	477	482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219681946
12	NC_011834	A	8	8	520	527	100 %	0 %	0 %	0 %	219681946
13	NC_011834	A	6	6	532	537	100 %	0 %	0 %	0 %	219681946
14	NC_011834	AAT	2	6	542	547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219681946
15	NC_011834	TGT	2	6	598	603	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219681946
16	NC_011834	GT	3	6	606	611	0 %	50 %	50 %	0 %	219681946
17	NC_011834	AATT	2	8	625	632	50 %	50 %	0 %	0 %	219681946
18	NC_011834	AGC	2	6	655	660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219681946
19	NC_011834	T	6	6	667	672	0 %	100 %	0 %	0 %	219681946
20	NC_011834	AGG	2	6	673	678	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219681946
21	NC_011834	CTG	2	6	708	713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219681946
22	NC_011834	CGC	2	6	798	803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219681946
23	NC_011834	TTA	2	6	839	844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219681946
24	NC_011834	T	6	6	873	878	0 %	100 %	0 %	0 %	219681946
25	NC_011834	CAT	2	6	899	904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219681946
26	NC_011834	CA	3	6	928	933	50 %	0 %	0 %	50 %	219681946
27	NC_011834	A	6	6	942	947	100 %	0 %	0 %	0 %	219681946
28	NC_011834	ATA	2	6	956	961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219681946
29	NC_011834	AT	3	6	986	991	50 %	50 %	0 %	0 %	219681946
30	NC_011834	T	6	6	997	1002	0 %	100 %	0 %	0 %	219681946
31	NC_011834	TAG	2	6	1167	1172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219681946
32	NC_011834	T	7	7	1234	1240	0 %	100 %	0 %	0 %	219681946
33	NC_011834	ATTA	2	8	1276	1283	50 %	50 %	0 %	0 %	219681946
34	NC_011834	T	6	6	1292	1297	0 %	100 %	0 %	0 %	219681946
35	NC_011834	ACT	2	6	1316	1321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219681946
36	NC_011834	GAA	2	6	1328	1333	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219681946
37	NC_011834	TTG	2	6	1349	1354	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219681946
38	NC_011834	GCA	2	6	1367	1372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219681946
39	NC_011834	GAT	2	6	1439	1444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219681946
40	NC_011834	ACT	2	6	1448	1453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219681946
41	NC_011834	CTTT	2	8	1505	1512	0 %	75 %	0 %	25 %	219681946
42	NC_011834	AGA	2	6	1516	1521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219681946
43	NC_011834	A	9	9	1636	1644	100 %	0 %	0 %	0 %	219681946
44	NC_011834	A	7	7	1681	1687	100 %	0 %	0 %	0 %	219681946
45	NC_011834	TA	3	6	1689	1694	50 %	50 %	0 %	0 %	219681946
46	NC_011834	TTAAT	2	10	1698	1707	40 %	60 %	0 %	0 %	219681946
47	NC_011834	TTA	2	6	1730	1735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219681946
48	NC_011834	TTG	2	6	1794	1799	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219681946
49	NC_011834	AGA	2	6	1864	1869	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219681946
50	NC_011834	A	6	6	1885	1890	100 %	0 %	0 %	0 %	219681946
51	NC_011834	ATC	2	6	1906	1911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219681946
52	NC_011834	TCT	2	6	1943	1948	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219681946
53	NC_011834	GTT	2	6	1952	1957	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219681946
54	NC_011834	A	6	6	1958	1963	100 %	0 %	0 %	0 %	219681946
55	NC_011834	GCT	2	6	2024	2029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219681946
56	NC_011834	TTA	2	6	2039	2044	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219681946
57	NC_011834	A	7	7	2053	2059	100 %	0 %	0 %	0 %	219681946
58	NC_011834	AT	3	6	2310	2315	50 %	50 %	0 %	0 %	219681947
59	NC_011834	TCA	2	6	2319	2324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219681947
60	NC_011834	AGAT	2	8	2339	2346	50 %	25 %	25 %	0 %	219681947
61	NC_011834	ATT	2	6	2362	2367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219681947
62	NC_011834	TCT	2	6	2383	2388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219681947
63	NC_011834	ATT	2	6	2390	2395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219681947
64	NC_011834	T	7	7	2419	2425	0 %	100 %	0 %	0 %	219681947
65	NC_011834	T	9	9	2442	2450	0 %	100 %	0 %	0 %	219681947
66	NC_011834	T	6	6	2456	2461	0 %	100 %	0 %	0 %	219681947
67	NC_011834	A	8	8	2472	2479	100 %	0 %	0 %	0 %	219681947
68	NC_011834	TATT	2	8	2603	2610	25 %	75 %	0 %	0 %	219681947
69	NC_011834	T	7	7	2615	2621	0 %	100 %	0 %	0 %	219681947
70	NC_011834	GATT	2	8	2646	2653	25 %	50 %	25 %	0 %	219681947
71	NC_011834	ATTT	2	8	2661	2668	25 %	75 %	0 %	0 %	219681947
72	NC_011834	CTG	2	6	2711	2716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219681947
73	NC_011834	ATATTA	2	12	2717	2728	50 %	50 %	0 %	0 %	219681947
74	NC_011834	GT	3	6	2747	2752	0 %	50 %	50 %	0 %	219681947
75	NC_011834	T	8	8	2752	2759	0 %	100 %	0 %	0 %	219681947
76	NC_011834	ATTTT	2	10	2761	2770	20 %	80 %	0 %	0 %	219681947
77	NC_011834	ATT	2	6	2910	2915	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219681947
78	NC_011834	TTTTA	2	10	2943	2952	20 %	80 %	0 %	0 %	219681947
79	NC_011834	TGC	2	6	2963	2968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219681947
80	NC_011834	TGG	2	6	2971	2976	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219681947
81	NC_011834	T	6	6	2985	2990	0 %	100 %	0 %	0 %	219681947
82	NC_011834	TAA	2	6	3020	3025	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219681947
83	NC_011834	TTTTAT	2	12	3039	3050	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	219681947
84	NC_011834	TA	3	6	3166	3171	50 %	50 %	0 %	0 %	219681948
85	NC_011834	TGG	2	6	3185	3190	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219681948
86	NC_011834	GGAATT	2	12	3217	3228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219681948
87	NC_011834	ATT	2	6	3279	3284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219681948
88	NC_011834	T	6	6	3295	3300	0 %	100 %	0 %	0 %	219681948
89	NC_011834	TA	3	6	3353	3358	50 %	50 %	0 %	0 %	219681948
90	NC_011834	AT	3	6	3565	3570	50 %	50 %	0 %	0 %	219681949
91	NC_011834	CCT	2	6	3575	3580	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219681949
92	NC_011834	ATT	2	6	3581	3586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219681949
93	NC_011834	A	7	7	3637	3643	100 %	0 %	0 %	0 %	219681949
94	NC_011834	TA	3	6	3657	3662	50 %	50 %	0 %	0 %	219681949
95	NC_011834	A	9	9	3669	3677	100 %	0 %	0 %	0 %	219681949
96	NC_011834	ATT	2	6	3689	3694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219681949
97	NC_011834	AGA	2	6	3757	3762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219681949
98	NC_011834	AGA	2	6	3781	3786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219681949
99	NC_011834	A	7	7	3791	3797	100 %	0 %	0 %	0 %	219681949
100	NC_011834	AGT	2	6	3865	3870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219681949
101	NC_011834	A	6	6	3894	3899	100 %	0 %	0 %	0 %	219681949
102	NC_011834	A	8	8	3905	3912	100 %	0 %	0 %	0 %	219681949
103	NC_011834	GAT	2	6	3923	3928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219681949
104	NC_011834	GTT	2	6	3937	3942	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219681949
105	NC_011834	CTT	2	6	3957	3962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219681949
106	NC_011834	AAT	2	6	4045	4050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219681950
107	NC_011834	AT	3	6	4070	4075	50 %	50 %	0 %	0 %	219681950
108	NC_011834	TTA	2	6	4082	4087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219681950
109	NC_011834	A	6	6	4105	4110	100 %	0 %	0 %	0 %	219681950
110	NC_011834	T	6	6	4119	4124	0 %	100 %	0 %	0 %	219681950
111	NC_011834	TGA	2	6	4188	4193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219681950
112	NC_011834	A	6	6	4200	4205	100 %	0 %	0 %	0 %	219681950
113	NC_011834	TAA	2	6	4208	4213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219681950
114	NC_011834	ATT	2	6	4215	4220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219681950
115	NC_011834	AT	3	6	4241	4246	50 %	50 %	0 %	0 %	219681950
116	NC_011834	ATA	2	6	4250	4255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219681950
117	NC_011834	CAT	2	6	4296	4301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219681950
118	NC_011834	TTC	2	6	4375	4380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219681950
119	NC_011834	A	8	8	4383	4390	100 %	0 %	0 %	0 %	219681950
120	NC_011834	TA	4	8	4398	4405	50 %	50 %	0 %	0 %	219681950
121	NC_011834	AAT	2	6	4447	4452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219681950
122	NC_011834	ATC	2	6	4478	4483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219681950
123	NC_011834	AT	3	6	4526	4531	50 %	50 %	0 %	0 %	219681951
124	NC_011834	ATTA	2	8	4559	4566	50 %	50 %	0 %	0 %	219681951
125	NC_011834	AAGA	2	8	4567	4574	75 %	0 %	25 %	0 %	219681951
126	NC_011834	AATC	2	8	4596	4603	50 %	25 %	0 %	25 %	219681951
127	NC_011834	TAT	2	6	4619	4624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219681951
128	NC_011834	TAT	2	6	4640	4645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219681951
129	NC_011834	TAA	2	6	4697	4702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219681951
130	NC_011834	T	6	6	4835	4840	0 %	100 %	0 %	0 %	219681951
131	NC_011834	AGT	2	6	4847	4852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219681951
132	NC_011834	ATG	2	6	4897	4902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219681951
133	NC_011834	T	7	7	4904	4910	0 %	100 %	0 %	0 %	219681951
134	NC_011834	AATT	2	8	5023	5030	50 %	50 %	0 %	0 %	219681951
135	NC_011834	ATT	2	6	5076	5081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219681951
136	NC_011834	ATT	2	6	5142	5147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219681951
137	NC_011834	TGT	2	6	5150	5155	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219681951
138	NC_011834	A	6	6	5157	5162	100 %	0 %	0 %	0 %	219681951
139	NC_011834	AGA	2	6	5165	5170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219681951
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401	NC_011834	T	6	6	15042	15047	0 %	100 %	0 %	0 %	219681959
402	NC_011834	TTTCT	2	10	15053	15062	0 %	80 %	0 %	20 %	219681959
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